- Title
-
Estonia - Tartu: Medical equipments
- Award criteria
-
priceOnly
- Award criteria details
-
Lowest price
Award criteria for item 1:
- Price
- Main procurement category
-
goods
- Procurement method details
-
Negotiated without a prior call for competition
Justification:
Tartu Ülikooli Kliinikumi Geneetika ja personaalmeditsiini kliinikul on vajadus osta uus ülegenoomseks analüüsiks järgmise põlvkonna sekveneerimise (NGS) metoodikal põhinev sekvenaator. Hetkel on laboris kasutusel 2 ühe tootja Illumina Netherlands BV sekvenaatorit, NextSeq 500 ja MiniSeq, mis kahjuks ei võimalda enam suurendada analüüside/proovide arvu, ajaliselt on masinate tööaeg saavutanud maksimaalse läbilaskvuse. Samuti ei võimalda antud instrumendid suuremahulist ülegenoomset st. eksoomi või genoomi sekveneerimist, mille järgi on viimastel aastatel kasvanud kliiniline nõudlus. Hetkel ostame eksoomi sekveneerimise teenust riigihankega väliselt teenuspakkujalt (GenomeScan), kuid plaan on hakata eksoomi ja genoomi sekveneerimise meetodit meie laboris teostama ning pakkuma ka TÜK partneritele kasutades uut NovaSeq X Plus instrumenti. Illumina firma poolt turustatav NovaSeq X Plus, lubab analüüsida korraga kõigile tunnustatud kvaliteedinõuetele vastavalt vähemalt 250 eksoomi proovi ja 24 genoomi proovi. Uus instrument kasutab ka uuenenud sekveneerimise tehnoloogiat, mis võimaldab oluliselt tõsta sekveneeritavate proovide hulka, mis muudab eksoomi ja genoomi järjestamise tunduvalt kuluefektiivsemaks võrreldes turul olemasolevate lahendustega.Hetkel on Illumina instrumentidele sobivatele reagentide ostmiseks kehtiv riigihange 6.9-3/2734, ning osaliselt on samu reagente võimalik kasutada ka uue soetataval instrumendil. NGS raamatukogude valmistamise puhul on oluline jätkata samade võrdlusandmebaasidega, mis on juba loodud TÜK Geneetika ja personaalmeditsiini kliinikul varasemalt analüüsitud patsientide põhjal. Analüüsi kvaliteedi huvides on oluline kasutada ka sama bioinformaatilise töötluse töövoogu, mis on Eesti Akrediteerimiskeskuse poolt akrediteeritud ning kasutusel praegu TÜK Geneetika ja personaalmeditsiini kliinikus. Bioinformaatilise töövoo muutmine sobivaks teiste tootjate tarkvaraga põhjustaks üleliigset koormust ja lisakulutusi, samuti on raskendatud võrdlus praeguse patsientide andmebaasiga.Riigihanke väljakuulutamine ei aitaks konkurentsi suurendada, kuna leidub ainult üks ettevõtja, kes suudab lepingut täita - Illumina Netherlands BV. Eestis Illumina firmal esindus puudub.
- Tender period
-
2023-01-16
-
?